Hanketoiminta on yksi PIKESin strategian mukaisista viidestä pääprosessista. Sen keskeisin tavoite on käynnistää, ohjata ja toteuttaa hankkeita, jotka vastaavat Pielisen Karjalan elinkeinostrategiassa määritettyihin uudistumis- ja kehittämistavoitteisiin. Prosessin ohjauksesta, toteutuksesta ja päivittämisestä vastaa PIKESin hanketoiminnan ohjelmapäällikkö.

PIKESin hanketoimintaa rahoittavat sen omistajat Lieksan ja Nurmeksen kaupungit sekä Valtimon kunta. Hanketoiminnan rahoituksesta on sovittu PIKESin osakassopimuksessa. Sen mukaisesti hanketoiminnan rahoitus on noin 20 euroa jokaista alueen kuntalaista kohden. Kokonaisuutena hanketoiminnan kuntarahoituksen suuruus on noin 450.000 euroa vuodessa.

Omistajakuntien PIKESille ohjaama kuntarahoitus jaetaan hanketoimintaan monin erin tavoin. Sillä rahoitetaan mm. Vaara-Karjalan Leader ry:n ohjelman mukaan Pielisen Karjalassa toteutuvien hankkeiden sekä Pielisen Karjalan KOKO ohjelman kuntarahoitusosuudet. Näiden lisäksi kuntarahoitusta ohjataan PIKESin itse toteuttamiin hankkeisiin ja PIKESin osatoteuttamiin hankkeisiin. Myös muut hanketoimijat voivat hakea PIKESin kuntarahoitusta. Tällöin rahoitusta haetaan erillisellä kuntarahoituslomakkeella. Vuosittain PIKES kuntarahoittaa noin 10 muiden toteuttamaa hanketta.

PIKESin hanketoiminta on sen omistajille ja seutumme väestölle kannattavaa sijoitustoimintaa. Esimerkiksi PIKESin omissa hankkeissa hankkeisiin ohjatun kuntarahan "monistuvuus" on 8-kertaista. Tämä tarkoittaa sitä, että jokainen omistajakuntien hanketoimintaan sijoittama euro tuo alueelle 7 euroa lisää. Tämä muu rahoitus tulee seutukunnallemme hankkeiden kautta EU:lta, Suomen valtiolta ja yrityksiltä. Rahan "monistuvuutta" tärkeämpää ovat kuitenkin PIKESin projektien aikaansaamat konkreettiset tulokset – uudet yritykset, työpaikat, paluumuuttajat, palvelut ja alueemme parantunut hyvinvointi.